固始县地方税务局内设七个职能科(室)、一个发票管理单位。七个科(室)为：办公室、计划财务科、征收管理科、政策法规科、人事科、监察审计室、信息站；发票管理单位发票管理所。

固始县地方税务局所辖11个中心税务所(分局)：城关分局、城郊中心税务所、胡族铺中心税务所、郭陆滩中心税务所、段集中心税务所、陈淋子中心税务所、石佛中心税务所、分水中心税务所、蒋集中心税务所、三河尖中心税务所、李店中心税务所，1个稽查局。负责全县营业税、个人所得税、土地增值税、城市建设维护税、车船使用税、房产税、资源税、城镇土地使用税、固定资产投资方向调节税、地方企业所得税、印花税、筵席税等12个税种和教育费附加、文化建设事业费的征收管理工作。